化学

Pythonでインフォマティクス

高校情報Ⅰ×化学探究【コード付】Pythonで分子の形を立体的(3D)に見る

化学構造式は平面(2D)で描かれますが、実際の分子の形は立体的(3D)です。 同じ平面構造でも3Dの形が異なる場合があり、これを「異性体」と呼びます。 異性体は形が違うと性質も異なるため、分子を3Dでとらえることは重要です。今回は、Pyth...
Pythonでインフォマティクス

高校情報Ⅰ×化学探究【コード付】Pythonで分子の性質を計算|薬の成分候補の探索

前回(情報Ⅰプログラミング×化学①)、Pythonで化学構造の表現形式SMILESと化学構造を扱うライブラリRDKit、そして化学データベースPubChemを使って、パソコンの上に分子の構造式を描画する方法を紹介しました。次は、Python...
Pythonでインフォマティクス

高校情報Ⅰ×化学探究【コード付】Pythonで化学の構造式を描こう!RDKit, SMILES, PubChem

構造式をパソコンで描いてみたい!高校の化学で学ぶ構造式を、Pythonのプログラミングを使って視覚化してみましょう!今回は、化学構造の表現形式SMILES(スマイルス)と、化学構造の描画ライブラリRDKit(アールディーキット)を使って、構...