Pythonでインフォマティクス Pythonで「判断できる」プログラムを作ろう!条件分岐, if文(情報Ⅰプラス②) Pythonで「判断できる」プログラムを作ろう!!判断できる、、たとえば、「80点以上なら合格」「IDとパスワードが正しいならログインを許可」など、“もし~なら” という判断を、どうやってしているのでしょうか??「ある条件のときに、特定の動... 2025.03.28 Pythonでインフォマティクス高校情報Ⅰと実践活用
Pythonでインフォマティクス Pythonの始め方と使い方 (インストール不要のGoogle Colaboratory)(情報Ⅰプラス) プログラミング言語のPythonはシンプルな文法で書けるため、様々な領域で使われ、多くの研究者やエンジニア、学生など幅広く利用されています。高校情報Ⅰでは、情報社会の問題解決、コミュニケーションと情報デザイン、コンピュータ、情報通信ネットワ... 2025.03.13 Pythonでインフォマティクス高校情報Ⅰと実践活用
Pythonでインフォマティクス OpenMM 8 : 機械学習ポテンシャルを利用した分子動力学シミュレーション このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7~)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・... 2024.01.17 Pythonでインフォマティクス
Pythonでインフォマティクス タンパク質の構造解析手法とIn silicoスクリーニングへの応用事例(株式会社技術情報協会出版)一部執筆担当 2023年7月に「タンパク質の構造解析手法とIn silicoスクリーニングへの応用事例」の書籍が株式会社技術情報協会様より発売になりました。この書籍の中の「第4章 分子シミュレーションによるタンパク質構造予測」において「第7節 OpenM... 2023.12.04 2023.12.06 Pythonでインフォマティクス書籍紹介
Pythonでインフォマティクス ChemBERTaのファインチューニングによる溶解度予測(DeBERTaベースのモデルやGCNも試してみました) このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介しています。 本記事では、前回紹介したSMILESを事前学習したモデル「ChemBERTa」を使用して、ファインチューニングによる溶... 2023.04.07 Pythonでインフォマティクス
Pythonでインフォマティクス ChemBERTa(分子の言語モデル)の紹介 このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介しています。今回の記事では、自然言語処理モデルBERTを分子へと応用した、ChemBERTaを紹介したいと思います。はじめにこれまで... 2023.03.22 2023.04.14 Pythonでインフォマティクス
Pythonでインフォマティクス EquiBind (深層学習によるタンパク質-リガンドドッキング予測)のインストール•使い方 このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介しています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築しています。● CPU Intel® Core™ i... 2022.05.08 2022.05.11 Pythonでインフォマティクス
Pythonでインフォマティクス GNINA 1.0 (AutoDock Vinaのスコア関数を深層学習で改良した!)のインストール•使い方 このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介しています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築しています。● CPU Intel® Core™ i... 2022.05.06 2022.05.07 Pythonでインフォマティクス
Pythonでインフォマティクス OpenMMによる分子動力学計算 :タンパク質フォールディングシミュレーション このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ... 2021.10.28 2024.01.15 Pythonでインフォマティクス
Pythonでインフォマティクス PyMOLによる分子構造の構築 :タンパク質フォールディングシミュレーション このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ... 2021.10.27 2021.10.28 Pythonでインフォマティクス