OpenMM

Pythonでインフォマティクス

OpenMM 8 : 機械学習ポテンシャルを利用した分子動力学シミュレーション

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7~)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード...
Pythonでインフォマティクス

OpenMMによる分子動力学計算 :タンパク質フォールディングシミュレーション

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2024.01.15
Pythonでインフォマティクス

PyMOLによる分子構造の構築 :タンパク質フォールディングシミュレーション

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2021.10.28
Pythonでインフォマティクス

OpenMMのインストール:タンパク質分子動力学シミュレーション

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2024.01.16
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