PythonでインフォマティクスOpenMM 8 : 機械学習ポテンシャルを利用した分子動力学シミュレーション
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7～）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード...
タンパク質
Pythonでインフォマティクス
PythonでインフォマティクスEquiBind (深層学習によるタンパク質-リガンドドッキング予測)のインストール•使い方
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介しています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築しています。 ● CPU Intel® Co...
PythonでインフォマティクスGNINA 1.0 (AutoDock Vinaのスコア関数を深層学習で改良した！)のインストール•使い方
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介しています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築しています。 ● CPU Intel® Co...
PythonでインフォマティクスOpenMMによる分子動力学計算 ：タンパク質フォールディングシミュレーション
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
PythonでインフォマティクスPyMOLによる分子構造の構築 ：タンパク質フォールディングシミュレーション
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PythonでインフォマティクスOpenMMのインストール：タンパク質分子動力学シミュレーション
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PythonでインフォマティクスAutoDock Vina 1.2 のチュートリアル
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PythonでインフォマティクスAutoDock Vina 1.2 のインストール
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PythonでインフォマティクスBLAST検索結果の分析：Jupyter notebook の使い方
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Pythonでインフォマティクスタンパク質一次構造による相同性検索：BLAST検索の使い方
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