Pythonでインフォマティクス BindCraft: AIが拓く新たなタンパク質バインダー設計 タンパク質は生命活動を担う多機能な生体分子であり、その機能の多くはタンパク質間相互作用(Protein-protein interactions:PPIs)によって発揮されています。このPPIsを標的として阻害や制御できるタンパク質バインダ... 2025.10.01 2025.10.02 Pythonでインフォマティクス
Pythonでインフォマティクス OpenMM 8 : 機械学習ポテンシャルを利用した分子動力学シミュレーション このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7~)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・... 2024.01.17 Pythonでインフォマティクス
Pythonでインフォマティクス EquiBind (深層学習によるタンパク質-リガンドドッキング予測)のインストール•使い方 このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介しています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築しています。● CPU Intel® Core™ i... 2022.05.08 2022.05.11 Pythonでインフォマティクス
Pythonでインフォマティクス GNINA 1.0 (AutoDock Vinaのスコア関数を深層学習で改良した!)のインストール•使い方 このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介しています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築しています。● CPU Intel® Core™ i... 2022.05.06 2022.05.07 Pythonでインフォマティクス
Pythonでインフォマティクス OpenMMによる分子動力学計算 :タンパク質フォールディングシミュレーション このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ... 2021.10.28 2024.01.15 Pythonでインフォマティクス
Pythonでインフォマティクス PyMOLによる分子構造の構築 :タンパク質フォールディングシミュレーション このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ... 2021.10.27 2021.10.28 Pythonでインフォマティクス
Pythonでインフォマティクス OpenMMのインストール:タンパク質分子動力学シミュレーション このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ... 2021.10.14 2024.01.16 Pythonでインフォマティクス
Pythonでインフォマティクス AutoDock Vina 1.2 のチュートリアル このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ... 2021.10.12 2021.11.08 Pythonでインフォマティクス
Pythonでインフォマティクス AutoDock Vina 1.2 のインストール このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ... 2021.09.18 2023.07.20 Pythonでインフォマティクス
Pythonでインフォマティクス BLAST検索結果の分析:Jupyter notebook の使い方 このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ... 2021.03.23 2021.11.08 Pythonでインフォマティクス