RDkit

Pythonでインフォマティクス

Pythonで分子の性質を調べる ー飲み薬の成分候補の探索ー(情報Ⅰプログラミング×化学②)

前回(情報Ⅰプログラミング×化学①)、Pythonで化学構造の表現形式SMILESと化学構造を扱うライブラリRDKit、そして化学データベースPubChemを使って、パソコンの上に分子の構造式を描画する方法を紹介しました。次は、Python...
Pythonでインフォマティクス

Pythonで化学の構造式を描こう!RDKit, SMILES, PubChem(情報Ⅰプログラミング×化学①)

構造式をパソコンで描いてみたい!高校の化学で学ぶ構造式を、Pythonのプログラミングを使って視覚化してみましょう!今回は、化学構造の表現形式SMILES(スマイルス)と、化学構造の描画ライブラリRDKit(アールディーキット)を使って、構...
Pythonでインフォマティクス

TensorFlowとPyTorchによる学習モデル作成 DeepChem チュートリアル 5

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス

Molecular Fingerprints DeepChem チュートリアル 4

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス

MoleculeNetの概要 DeepChem チュートリアル 3

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス

DeepChem によるケモインフォマティクス、チュートリアル 2

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス

DeepChemのインストールとチュートリアル 1

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...