BLAST

Pythonでインフォマティクス

HH-suite3を使った高感度な相同性検索:インストールとデータベースの準備

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス

BLAST検索結果の分析:Jupyter notebook の使い方

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス

BLAST検索結果の分析:テキスト処理とJupyter notebookのインストール

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス

タンパク質一次構造による相同性検索:BLAST検索の使い方

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス

タンパク質一次構造による相同性検索:BLASTのインストール

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...