DeepChem

Pythonでインフォマティクス

ChemBERTaのファインチューニングによる溶解度予測(DeBERTaベースのモデルやGCNも試してみました)

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介しています。 本記事では、前回紹介したSMILESを事前学習したモデル「ChemBERTa」を使用して、ファインチューニン...
Pythonでインフォマティクス

ChemBERTa(分子の言語モデル)の紹介

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介しています。 今回の記事では、自然言語処理モデルBERTを分子へと応用した、ChemBERTaを紹介したいと思います。 ...
2023.04.14
Pythonでインフォマティクス

TensorFlowとPyTorchによる学習モデル作成 DeepChem チュートリアル 5

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2021.10.18
Pythonでインフォマティクス

Molecular Fingerprints DeepChem チュートリアル 4

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2021.10.18
Pythonでインフォマティクス

MoleculeNetの概要 DeepChem チュートリアル 3

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2021.10.18
Pythonでインフォマティクス

DeepChem によるケモインフォマティクス、チュートリアル 2

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2021.10.15
Pythonでインフォマティクス

DeepChemのインストールとチュートリアル 1

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2021.10.15
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