Rでデータ解析と可視化 書籍紹介２ RユーザーのためのRStudio[実践]入門、Rグラフィックスクックブック
R関連の書籍紹介２です。RユーザーのためのRStudio入門（技術評論社）最初はRで作業をしていましたが、初めてRStudioで作業をしたとき、なんてすばらしい環境なのかと。。感動したのを覚えています。今思えば、Rでの作業が探り探りだったこ...
Rでデータ解析と可視化 
Rでデータ解析と可視化 Rでヒストグラム（度数分布）ーhistー
データの取り込みについては、以下に投稿しています。Rを活用して、誰にでもわかりやすく解析結果を共有出来る資料につなげていきたいと思います。今回取り組むのは、ヒストグラム （ 度数分布を表すグラフで、あるデータ区間ごとに存在するサンプルの数を...
Rでデータ解析と可視化 Rにデータ取り込み ーCSV(read.csv), TSV(read.delim), Excel(readxlパッケージ, read_excel)ー
前回の記事で説明したCSVファイルと、同じようにRStudioの作業で使いやすいTSVファイルについて説明させて頂きます。CSVとTSVファイルは、いわゆるテキストファイルであり、データそのもの以外の情報はありません。一方、ExcelやGo...
Pythonでインフォマティクス HH-suite3を使った高感度な相同性検索：インストールとデータベースの準備
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス BLAST検索結果の分析：Jupyter notebook の使い方
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス BLAST検索結果の分析：テキスト処理とJupyter notebookのインストール
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Rでデータ解析と可視化 Rでのデータ取り込みとデータ作成 ーCSVファイル(read.csv)ー
前回の記事で、Rの作業環境として、RStudioの基本的な使い方を説明しました。今回は、RStudio上で、実際にRを動かします。まずは、自前のデータをRに取り込みます。といっても、どんなデータを使うの？？ということで、誰もが使えるようなデ...
Pythonでインフォマティクス タンパク質一次構造による相同性検索：BLAST検索の使い方
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス タンパク質一次構造による相同性検索：BLASTのインストール
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Rでデータ解析と可視化 RStudioの基本的な使い方 ー作業場所とデータの管理・保存についてー
前回の記事ではRとその作業環境としてのRStudioのインストールの方法を説明しました。こちらの記事では、Rを使っていくために、RStudioの基本的な使い方を説明します。基本的な使い方として、作業場所 と データの管理・保存 について書き...