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Rで3群以上の検定 ー分散分析(ANOVA, aov関数)、多重比較(Tukey法, tukeyHSD関数)ー

統計的検定は、グループ間の違いを明らかにするための重要なツールです。 二つのグループを比較する方法とそのRのコードについて、以前紹介させていただきました。 今回は、3つ以上のグループを比較する方法について紹介...
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Rでデータの結合② ー列の結合, cbind関数, merge関数ー

データの解析において、複数のデータソースから情報を統合することは重要です。 この記事では、Rを使用してデータの結合(列の結合)を行う方法について紹介します。 データの結合は、データ解析において欠かせないステップで...
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Rでデータの結合① ー行の結合, rbind関数, bind_rows関数ー

データの結合は、データ解析において非常に重要な操作の一つです。 複数のデータソースから情報を統合することで、より包括的な分析が可能になります。 この記事では、Rを使用してデータの結合(行の結合)を行う方法について紹介します。 ...
2024.05.01
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Rでデータの選択 ーsubset関数, filter関数などー

Rを用いてデータの選択を行う方法について紹介します。 irisデータセットを例に挙げ、列や行を指定してデータを選択する方法や、特定の条件を満たすデータを選択する方法について解説します。
2024.04.30
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Rで欠損値の処理 ーna.omit, is.na, na.rm, 欠損値含むダミーデータ作成ー

データ解析を行うデータを確認すると、データの抜け、いわゆる「欠損値」があることがあります。 欠損値があると、データの解析やモデリングが適切に行えない可能性があります。 この記事では、Rでの欠損値の処理方法について解説します。 ■目次 ...
2024.04.19
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Rでメタアナリシス ー統合的なデータ解析, meta, metafor, 臨床試験などー

メタアナリシスは、複数の関連研究からデータを統合し、効果量を定量的に評価する統計手法です。 臨床試験でよく使用されますが、例えば特定治療法の効果を各試験ごとに検討し、結果を統合することで治療法の総合的な効果を把握します。 ひとつの試験か...
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Rでアップセット図(UpSet図) ーUpSetR, 集合の関係性を示す, サンプル数が多い場合におススメー

今回は、アップセット図(UpSet図)についてRのコード例を紹介したいと思います。 アップセット図(UpSet図)とは? ベン図とは違うアプローチで、集合の関係性を視覚的に示す図です。 RのUpSe...
2024.02.16
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Rでベン図 ーggVennDiagram, venn, 最大7サンプル表示可能にー

ベン図は、集合論や統計学で広く使用され、重なりや包含関係を視覚的に理解するのに役立ちます。 異なるグループの要素の交わりや固有の特性を把握し、データの関連性を把握するのにとても便利です。 ■目次 1. ベン図とは 2. ベン図用ダミ...
2024.02.15
ウェルビーイング

ウェルビーイグ 精神的状態が身体的状態に影響を与える 心疾患に関する文献紹介

Well-being(ウェルビーイング)とは、個人の権利や自己実現が保障され、身体的・精神的・社会的に良好な状態であることを言います。 「身体的に良好である」、「精神的に良好である」、「社会的に良好である」、これらは独立したことではなく、...
Pythonでインフォマティクス

OpenMM 8 : 機械学習ポテンシャルを利用した分子動力学シミュレーション

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7~)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード...
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