RでプレゼンテーションRでデータの選択 ーsubset関数, filter関数などー
Rを用いてデータの選択を行う方法について紹介します。 irisデータセットを例に挙げ、列や行を指定してデータを選択する方法や、特定の条件を満たすデータを選択する方法について解説します。
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Rでプレゼンテーション
RでプレゼンテーションRで欠損値の処理 ーna.omit, is.na, na.rm, 欠損値含むダミーデータ作成ー
データ解析を行うデータを確認すると、データの抜け、いわゆる「欠損値」があることがあります。 欠損値があると、データの解析やモデリングが適切に行えない可能性があります。 この記事では、Rでの欠損値の処理方法について解説します。 ■目次 ...
RでプレゼンテーションRでメタアナリシス ー統合的なデータ解析, meta, metafor, 臨床試験などー
メタアナリシスは、複数の関連研究からデータを統合し、効果量を定量的に評価する統計手法です。 臨床試験でよく使用されますが、例えば特定治療法の効果を各試験ごとに検討し、結果を統合することで治療法の総合的な効果を把握します。 ひとつの試験か...
RでプレゼンテーションRでアップセット図（UpSet図） ーUpSetR, 集合の関係性を示す, サンプル数が多い場合におススメー
今回は、アップセット図（UpSet図）についてRのコード例を紹介したいと思います。 アップセット図（UpSet図）とは？ ベン図とは違うアプローチで、集合の関係性を視覚的に示す図です。 RのUpSe...
RでプレゼンテーションRでベン図 ーggVennDiagram, venn, 最大7サンプル表示可能にー
ベン図は、集合論や統計学で広く使用され、重なりや包含関係を視覚的に理解するのに役立ちます。 異なるグループの要素の交わりや固有の特性を把握し、データの関連性を把握するのにとても便利です。 ■目次 1. ベン図とは 2. ベン図用ダミ...
ウェルビーイングウェルビーイグ 精神的状態が身体的状態に影響を与える 心疾患に関する文献紹介
Well-being（ウェルビーイング）とは、個人の権利や自己実現が保障され、身体的・精神的・社会的に良好な状態であることを言います。 「身体的に良好である」、「精神的に良好である」、「社会的に良好である」、これらは独立したことではなく、...
PythonでインフォマティクスOpenMM 8 : 機械学習ポテンシャルを利用した分子動力学シミュレーション
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7～）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード...
ウェルビーイングウェルビーイングと統計 ー血圧が高い①、減塩と血圧の臨床文献ー
「ウェルビーイング（well-being※）」 ※身体的・精神的・社会的に良好な状態。“心と体と社会がいい状態” ウェルビーイングと統計の関係 身体的・精神的な健康度合いをどのように計測すればよいでしょうか。また、そもそも「幸...
RでプレゼンテーションRで変数ごとに表示をカスタマイズできるヒートマップ ー革新的な可視化, funkyheatmapー
データ分析では、得られた結果を明確に示す可視化がとても重要です。 以前、相関行列のヒートマップについて解説をしました。 今回は、多彩なカスタマイズが可能な「funkyheatmap」パッケージを紹介します。 ■目次 1...
RでプレゼンテーションRでクラスター分析② ー非階層クラスター分析, k平均法, kmeansー
クラスター分析の主な目的は、サンプルのデータの類似性やパターンに基づいて、サンプルをクラスター化することです。 クラスター分析は教師なし学習であり、サンプルに対して事前に定義されたラベルやカテゴリがなくても、サンプルのクラスター化を行うこ...