RでプレゼンテーションRでアップセット図(UpSet図) ーUpSetR, 集合の関係性を示す, サンプル数が多い場合におススメー 今回は、アップセット図(UpSet図)についてRのコード例を紹介したいと思います。 アップセット図(UpSet図)とは? ベン図とは違うアプローチで、集合の関係性を視覚的に示す図です。 RのUpSe... 2024.02.15 2024.02.16Rでプレゼンテーション
RでプレゼンテーションRでベン図 ーggVennDiagram, venn, 最大7サンプル表示可能にー ベン図は、集合論や統計学で広く使用され、重なりや包含関係を視覚的に理解するのに役立ちます。 異なるグループの要素の交わりや固有の特性を把握し、データの関連性を把握するのにとても便利です。 ■目次 1. ベン図とは 2. ベン図用ダミ... 2024.02.13 2024.02.15Rでプレゼンテーション
ウェルビーイングウェルビーイグ 精神的状態が身体的状態に影響を与える 心疾患に関する文献紹介 Well-being(ウェルビーイング)とは、個人の権利や自己実現が保障され、身体的・精神的・社会的に良好な状態であることを言います。 「身体的に良好である」、「精神的に良好である」、「社会的に良好である」、これらは独立したことではなく、... 2024.02.06ウェルビーイング
PythonでインフォマティクスOpenMM 8 : 機械学習ポテンシャルを利用した分子動力学シミュレーション このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7~)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード... 2024.01.17Pythonでインフォマティクス
ウェルビーイングウェルビーイングと統計 ー血圧が高い①、減塩と血圧の臨床文献ー 「ウェルビーイング(well-being※)」 ※身体的・精神的・社会的に良好な状態。“心と体と社会がいい状態” ウェルビーイングと統計の関係 身体的・精神的な健康度合いをどのように計測すればよいでしょうか。また、そもそも「幸... 2024.01.16 2024.01.25ウェルビーイング
RでプレゼンテーションRで変数ごとに表示をカスタマイズできるヒートマップ ー革新的な可視化, funkyheatmapー データ分析では、得られた結果を明確に示す可視化がとても重要です。 以前、相関行列のヒートマップについて解説をしました。 今回は、多彩なカスタマイズが可能な「funkyheatmap」パッケージを紹介します。 ■目次 1... 2024.01.08 2024.01.10Rでプレゼンテーション
RでプレゼンテーションRでクラスター分析② ー非階層クラスター分析, k平均法, kmeansー クラスター分析の主な目的は、サンプルのデータの類似性やパターンに基づいて、サンプルをクラスター化することです。 クラスター分析は教師なし学習であり、サンプルに対して事前に定義されたラベルやカテゴリがなくても、サンプルのクラスター化を行うこ... 2023.12.26 2024.05.28Rでプレゼンテーション
Pythonでインフォマティクスタンパク質の構造解析手法とIn silicoスクリーニングへの応用事例(株式会社技術情報協会出版)一部執筆担当 2023年7月に「タンパク質の構造解析手法とIn silicoスクリーニングへの応用事例」の書籍が株式会社技術情報協会様より発売になりました。 この書籍の中の「第4章 分子シミュレーションによるタンパク質構造予測」において「第7節 Ope... 2023.12.04 2023.12.06Pythonでインフォマティクス書籍紹介
RでプレゼンテーションGoogle Colaboratory上でのRの作業方法+Google Driveのデータの保存・読み込み方法 Google Colaboratoryは、web上で PythonだけでなくRの作業ができます。専用の環境構築も不要という点、無料という点、でも、初心者も使用しやすいツールになっています。 ただし、Googleアカウントは必要ですので、ア... 2023.07.15 2024.01.06Rでプレゼンテーション
RでプレゼンテーションRで作図を高解像度に保存する方法について ーpng(), ggsave() などー Rで作図したものを、論文や著書で使用するため、高解像度で保存する方法は? Rは、データの視覚化にとても便利なツールです。データの詳細な分析や学術論文の掲載時には、作った図を高解像度で保存したいですよね。 ... 2023.04.19 2024.05.27Rでプレゼンテーション