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Pythonでインフォマティクス

BLAST検索結果の分析:Jupyter notebook の使い方

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2021.11.08
Pythonでインフォマティクス

BLAST検索結果の分析:テキスト処理とJupyter notebookのインストール

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2021.11.08
Rでプレゼンテーション

Rでのデータ取り込みとデータ作成 ーCSVファイル(read.csv)ー

前回の記事で、Rの作業環境として、RStudioの基本的な使い方を説明しました。 今回は、RStudio上で、実際にRを動かします。 まずは、自前のデータをRに取り込みます。 といっても、どんなデータを使うの??と...
2024.04.18
Pythonでインフォマティクス

タンパク質一次構造による相同性検索:BLAST検索の使い方

  このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード...
2021.11.08
Pythonでインフォマティクス

タンパク質一次構造による相同性検索:BLASTのインストール

  このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード...
2023.07.13
Rでプレゼンテーション

RStudioの基本的な使い方 ー作業場所とデータの管理・保存についてー

前回の記事ではRとその作業環境としてのRStudioのインストールの方法を説明しました。 こちらの記事では、Rを使っていくために、RStudioの基本的な使い方を説明します。 基本的な使い方として、作業場所 と データの...
2021.11.06
Rでプレゼンテーション

RとRStudioのインストール方法

前回の記事でRの魅力について触れました。 データサイエンスはこれからだ!という方に向けて、Rとその作業環境としてお勧めしたいRStudioのインストール方法を説明をしていきます。 ◆Rのインストール Rのダウンロー...
2021.11.06
Rでプレゼンテーション

書籍紹介1 Rで学ぶ統計データ解析、データサイエンティスト養成読本

R関連の書籍紹介。 「Rで学ぶ統計的データ解析 林健一著 (講談社サイエンティフィク)」 Rの勉強を、必要な作業だけ抜粋して進めてきてしまったので、一度基本に立ち返るために購入しました。 そういえばこれやっ...
2021.04.16
Rでプレゼンテーション

無料で使える統計解析ソフトウェア Rの魅力

前回の記事では、データサイエンスを始めたい方へ、はじめにーRでプレゼンテーションー を書かせていただきました。 こちらでは、無料で使える統計解析ソフトウェア Rの魅力ということで、Rについて少し触れます。 Rは統計とグラ...
2021.11.06
Pythonでインフォマティクス

LightDock チュートリアル : タンパク質のドッキングシミュレーション

  このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード...
2021.11.06
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