Rでプレゼンテーション

Rで対応のない2群検定:Mann-Whitney U検定、Wilcoxon Rank-Sum 検定、箱ひげ図、バイオリンプロット

例えば、数学のテストでXクラスとYクラスで平均点に差があるのか?ないのか?を調べたいとします。 このクラスの点数は、他のクラスと比べて差があるのか??? これは、XクラスとYクラスが異なる学生からなり、それぞれが受けた数学のテス...
2022.06.30
Rでプレゼンテーション

Rで対応のない2群検定:Student t 検定, Welch’s t検定, 箱ひげ図, バイオリンプロット,ビースウォームプロット

例えば、国語のテストがあった時に、XクラスとYクラスのテストの点数の平均値に差があるのか?ないのか?を知りたいとします。 隣のクラスと差があるのか..?? 各クラスのテストの点数の平均値を比較する際に使用するのは対応のない2群の...
2023.02.02
Pythonでインフォマティクス

OpenMMによる分子動力学計算 :タンパク質フォールディングシミュレーション

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2024.01.15
Pythonでインフォマティクス

PyMOLによる分子構造の構築 :タンパク質フォールディングシミュレーション

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2021.10.28
Pythonでインフォマティクス

OpenMMのインストール:タンパク質分子動力学シミュレーション

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2024.01.16
Pythonでインフォマティクス

AutoDock Vina 1.2 のチュートリアル

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2021.11.08
Pythonでインフォマティクス

TensorFlowとPyTorchによる学習モデル作成 DeepChem チュートリアル 5

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2021.10.18
Pythonでインフォマティクス

Molecular Fingerprints DeepChem チュートリアル 4

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2021.10.18
Pythonでインフォマティクス

MoleculeNetの概要 DeepChem チュートリアル 3

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2021.10.18
Pythonでインフォマティクス

DeepChem によるケモインフォマティクス、チュートリアル 2

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2021.10.15
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