Rでデータ解析と可視化 Rで対応のない2群検定：Student t 検定, Welch’s t検定, 箱ひげ図, バイオリンプロット,ビースウォームプロット
例えば、国語のテストがあった時に、XクラスとYクラスのテストの点数の平均値に差があるのか？ないのか？を知りたいとします。隣のクラスと差があるのか..？？各クラスのテストの点数の平均値を比較する際に使用するのは対応のない2群の検定です。各クラ...
Rでデータ解析と可視化 
Pythonでインフォマティクス OpenMMによる分子動力学計算 ：タンパク質フォールディングシミュレーション
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス PyMOLによる分子構造の構築 ：タンパク質フォールディングシミュレーション
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス OpenMMのインストール：タンパク質分子動力学シミュレーション
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス AutoDock Vina 1.2 のチュートリアル
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス TensorFlowとPyTorchによる学習モデル作成 DeepChem チュートリアル ５
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス Molecular Fingerprints DeepChem チュートリアル 4
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス MoleculeNetの概要 DeepChem チュートリアル 3
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス DeepChem によるケモインフォマティクス、チュートリアル 2
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Rでデータ解析と可視化 Rで相関係数のヒートマップによる可視化：新型コロナ陽性者数の都道府県別動向 ーcorrplotー
以前の投稿で、熊本県の新型コロナ陽性者数動向と他都道府県との相関関係について書きました。厚労省のオープンデータを用いて、引き続きデータ解析を行います。#1 #2まで以前の投稿と同じ部分。patient_prefecture<-read.cs...