Pythonでインフォマティクス PyMOLによる分子構造の構築 ：タンパク質フォールディングシミュレーション
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス 
Pythonでインフォマティクス OpenMMのインストール：タンパク質分子動力学シミュレーション
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス AutoDock Vina 1.2 のチュートリアル
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Pythonでインフォマティクス TensorFlowとPyTorchによる学習モデル作成 DeepChem チュートリアル ５
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス Molecular Fingerprints DeepChem チュートリアル 4
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス MoleculeNetの概要 DeepChem チュートリアル 3
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス DeepChem によるケモインフォマティクス、チュートリアル 2
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Rでデータ解析と可視化 Rで相関係数のヒートマップによる可視化：新型コロナ陽性者数の都道府県別動向 ーcorrplotー
以前の投稿で、熊本県の新型コロナ陽性者数動向と他都道府県との相関関係について書きました。厚労省のオープンデータを用いて、引き続きデータ解析を行います。#1 #2まで以前の投稿と同じ部分。patient_prefecture<-read.cs...
Rでデータ解析と可視化 Rで時系列データの可視化：新型コロナ陽性者数の県別動向 ーgeom_lineー
厚労省のオープンデータとして、各都道府県における1日当たりのコロナ陽性患者数情報を入手することができます。熊本県の新型コロナ陽性患者数動向において、相関の高い都道府県はどこか？について調べたいと思います。患者数動向は、時系列データの1種です...
Pythonでインフォマティクス AutoDock Vina 1.2 のインストール
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