RでプレゼンテーションRでヒストグラム（度数分布）ーhistー
データの取り込みについては、以下に投稿しています。 Rを活用して、誰にでもわかりやすく解析結果を共有出来る資料につなげていきたいと思います。 今回取り組むのは、ヒストグラム （ 度数分布を表すグラフで、あるデータ...
Rでプレゼンテーション
RでプレゼンテーションRにデータ取り込み ーCSV(read.csv), TSV(read.delim), Excel(readxlパッケージ, read_excel)ー
前回の記事で説明したCSVファイルと、同じようにRStudioの作業で使いやすいTSVファイルについて説明させて頂きます。 CSVとTSVファイルは、いわゆるテキストファイルであり、データそのもの以外の情報はありません。 ...
PythonでインフォマティクスHH-suite3を使った高感度な相同性検索：インストールとデータベースの準備
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード...
PythonでインフォマティクスBLAST検索結果の分析：Jupyter notebook の使い方
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
PythonでインフォマティクスBLAST検索結果の分析：テキスト処理とJupyter notebookのインストール
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
RでプレゼンテーションRでのデータ取り込みとデータ作成 ーCSVファイル(read.csv)ー
前回の記事で、Rの作業環境として、RStudioの基本的な使い方を説明しました。 今回は、RStudio上で、実際にRを動かします。 まずは、自前のデータをRに取り込みます。 といっても、どんなデータを使うの？？と...
Pythonでインフォマティクスタンパク質一次構造による相同性検索：BLAST検索の使い方
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード...
Pythonでインフォマティクスタンパク質一次構造による相同性検索：BLASTのインストール
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード...
RでプレゼンテーションRStudioの基本的な使い方 ー作業場所とデータの管理・保存についてー
前回の記事ではRとその作業環境としてのRStudioのインストールの方法を説明しました。 こちらの記事では、Rを使っていくために、RStudioの基本的な使い方を説明します。 基本的な使い方として、作業場所 と データの...
RでプレゼンテーションRとRStudioのインストール方法
前回の記事でRの魅力について触れました。 データサイエンスはこれからだ！という方に向けて、Rとその作業環境としてお勧めしたいRStudioのインストール方法を説明をしていきます。 ◆Rのインストール Rのダウンロー...