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Pythonでインフォマティクス

AutoDock Vina 1.2 のチュートリアル

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2021.11.08
Pythonでインフォマティクス

TensorFlowとPyTorchによる学習モデル作成 DeepChem チュートリアル 5

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2021.10.18
Pythonでインフォマティクス

Molecular Fingerprints DeepChem チュートリアル 4

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2021.10.18
Pythonでインフォマティクス

MoleculeNetの概要 DeepChem チュートリアル 3

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2021.10.18
Pythonでインフォマティクス

DeepChem によるケモインフォマティクス、チュートリアル 2

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2021.10.15
Rでプレゼンテーション

Rで相関係数のヒートマップによる可視化:新型コロナ陽性者数の都道府県別動向 ーcorrplotー

以前の投稿で、熊本県の新型コロナ陽性者数動向と他都道府県との相関関係について書きました。 厚労省のオープンデータを用いて、引き続きデータ解析を行います。 #1 #2まで以前の投稿と同じ部分。 patient_pre...
2024.01.06
Rでプレゼンテーション

Rで時系列データの可視化:新型コロナ陽性者数の県別動向 ーgeom_lineー

厚労省のオープンデータとして、各都道府県における1日当たりのコロナ陽性患者数情報を入手することができます。 熊本県の新型コロナ陽性患者数動向において、相関の高い都道府県はどこか?について調べたいと思います。 患者数動向は、時系列データの...
2024.01.06
Pythonでインフォマティクス

AutoDock Vina 1.2 のインストール

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2023.07.20
Pythonでインフォマティクス

DeepChemのインストールとチュートリアル 1

このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系(3.7)、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
2021.10.15
書籍紹介

書籍紹介3 実験で使うとこだけ生物統計1 キホンノキ、実験で使うとこだけ生物統計2 キホンノキ

実験で使うとこだけ生物統計1 キホンノキ 改訂 実験を行う際には、得られるであろう結果を想定して組み立てを行っていくことになるかと思います。 実験した後で、解析をうーんと考えるのは良くない。なぜなら~...
2021.09.18
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