Rでデータ解析と可視化Rでコレスホﾟンデンス分析ー対応分析, CA, fviz_ca_biplot, repelー
各家庭における家事は、それぞれどんな分担傾向があるのか？？？ 夫のみ、妻のみ、夫婦一緒に、夫婦どちらかが、行う家事はどういった傾向がみられるのか？実施頻度の情報が、目で見て分かり易い図を作ってみます。 この度は、コレスホ...
Rでデータ解析と可視化
Rでデータ解析と可視化Rで回帰分析②ー重回帰分析, lm関数, 価格予測ー
AをB、C、Dなどの複数の要因で予測したいという場合に、重回帰分析が用いられます。 例えば、住宅の価格（目的変数）を、町ごとの一人当たり犯罪率、1940年以前に建てられた持ち家の割合、ボストンの5つの雇用中心地までの距離の加重平均のデ...
PythonでインフォマティクスEquiBind (深層学習によるタンパク質-リガンドドッキング予測)のインストール•使い方
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介しています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築しています。 ● CPU Intel® Co...
PythonでインフォマティクスGNINA 1.0 (AutoDock Vinaのスコア関数を深層学習で改良した！)のインストール•使い方
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介しています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築しています。 ● CPU Intel® Co...
Rでデータ解析と可視化Rで回帰分析① ー単回帰分析, lm関数, 残差プロット, Q-Qプロットー
車の運転速度が速いほど、ブレーキを踏んでから停止するまでに必要な距離は長くなる💡 これは日常の運転でも実感できる事象かと思います。 このような関係性をデータから数式で表現し、予測に活用できる手法である単回帰分析です。 ...
Rでデータ解析と可視化Rで対応のない2群検定：Mann-Whitney U検定、Wilcoxon Rank-Sum 検定、箱ひげ図、バイオリンプロット
例えば、数学のテストでXクラスとYクラスで平均点に差があるのか？ないのか？を調べたいとします。 このクラスの点数は、他のクラスと比べて差があるのか？？？ これは、XクラスとYクラスが異なる学生からなり、それぞれが受けた数学のテストの点数...
Rでデータ解析と可視化Rで対応のない2群検定：Student t 検定, Welch’s t検定, 箱ひげ図, バイオリンプロット,ビースウォームプロット
例えば、国語のテストがあった時に、XクラスとYクラスのテストの点数の平均値に差があるのか？ないのか？を知りたいとします。 隣のクラスと差があるのか..？？ 各クラスのテストの点数の平均値を比較する際に使用するのは対応のない2群の検定...
PythonでインフォマティクスOpenMMによる分子動力学計算 ：タンパク質フォールディングシミュレーション
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
PythonでインフォマティクスPyMOLによる分子構造の構築 ：タンパク質フォールディングシミュレーション
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...
PythonでインフォマティクスOpenMMのインストール：タンパク質分子動力学シミュレーション
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・...