Rでデータ解析と可視化 Rにデータ取り込み ーCSV(read.csv), TSV(read.delim), Excel(readxlパッケージ, read_excel)ー
前回の記事で説明したCSVファイルと、同じようにRStudioの作業で使いやすいTSVファイルについて説明させて頂きます。CSVとTSVファイルは、いわゆるテキストファイルであり、データそのもの以外の情報はありません。一方、ExcelやGo...
Rでデータ解析と可視化 
Pythonでインフォマティクス HH-suite3を使った高感度な相同性検索：インストールとデータベースの準備
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス BLAST検索結果の分析：Jupyter notebook の使い方
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス BLAST検索結果の分析：テキスト処理とJupyter notebookのインストール
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Rでデータ解析と可視化 Rでのデータ取り込みとデータ作成 ーCSVファイル(read.csv)ー
前回の記事で、Rの作業環境として、RStudioの基本的な使い方を説明しました。今回は、RStudio上で、実際にRを動かします。まずは、自前のデータをRに取り込みます。といっても、どんなデータを使うの？？ということで、誰もが使えるようなデ...
Pythonでインフォマティクス タンパク質一次構造による相同性検索：BLAST検索の使い方
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Pythonでインフォマティクス タンパク質一次構造による相同性検索：BLASTのインストール
このカテゴリーの記事では、「Pythonを使った機械学習やケモ・バイオインフォマティクスの実装や論文」を紹介していきたいと考えています。Python は3系（3.7）、anacondaを中心にして環境構築していきます。以下のようなハード・ソ...
Rでデータ解析と可視化 RStudioの基本的な使い方 ー作業場所とデータの管理・保存についてー
前回の記事ではRとその作業環境としてのRStudioのインストールの方法を説明しました。こちらの記事では、Rを使っていくために、RStudioの基本的な使い方を説明します。基本的な使い方として、作業場所 と データの管理・保存 について書き...
Rでデータ解析と可視化 RとRStudioのインストール方法
前回の記事でRの魅力について触れました。データサイエンスはこれからだ！という方に向けて、Rとその作業環境としてお勧めしたいRStudioのインストール方法を説明をしていきます。◆RのインストールRのダウンロードはこちらのサイトから、以下の画...
Rでデータ解析と可視化 書籍紹介1 Rで学ぶ統計データ解析、データサイエンティスト養成読本
R関連の書籍紹介。「Rで学ぶ統計的データ解析 林健一著 （講談社サイエンティフィク）」Rの勉強を、必要な作業だけ抜粋して進めてきてしまったので、一度基本に立ち返るために購入しました。そういえばこれやったことなかったというものもあり、Rを少し...