Rでデータ解析と可視化 Rでクラスター分析② ー非階層クラスター分析, k平均法, kmeans,clusplotー
クラスター分析の主な目的は、サンプルのデータの類似性やパターンに基づいて、サンプルをグループに分けることです。クラスター分析は教師なし学習であり、サンプルに対してあらかじめ定義されたラベルやカテゴリがなくても、サンプルをグループ分けすること...
Rでデータ解析と可視化
Rでデータ解析と可視化 
Rでデータ解析と可視化 Google Colaboratory上でのRの作業方法＋Google Driveのデータの保存・読み込み方法
Google Colaboratoryは、web上で PythonだけでなくRの作業ができます。専用の環境構築も不要という点、無料という点、でも、初心者も使用しやすいツールになっています。ただし、Googleアカウントは必要ですので、アカウ...
Rでデータ解析と可視化 Rで作図を高解像度に保存する方法について ーpng(), ggsave() などー
Rで作図したものを、論文や著書で使用するため、高解像度で保存する方法は？Rは、データの視覚化にとても便利なツールです。データの詳細な分析や学術論文の掲載時には、作った図を高解像度で保存したいですよね。■目次 1. はじめに 画像のサイズと解...
Rでデータ解析と可視化 Rでクラスター分析① ー階層クラスター分析, hclust, dist, シルエット分析, silhouetteー
多くの製品があって、どの製品とどの製品が似ているのか、似ていないのか？などを調べるにはどうすればよいでしょう？似ているもの同士を集めたり、似ていないものと区別するには、クラスター分析が大変役に立ちます。例えば、ワインの成分情報から、クラスタ...
Rでデータ解析と可視化 Rで生存時間解析①単変数で予測 ーカプラン・マイヤー曲線,survfit関数、ログランク検定,survdiff関数ー
臨床現場で白血病患者の治療をしない群（コントロール群）と治療群の生存時間のデータを取得している。取得データから、各群の白血病患者の生存時間を予測したい。また、コントロール群と治療群の2群のデータがあり、それらの2群の比較も合わせて行いたい。...
Rでデータ解析と可視化 Rでコレスホﾟンデンス分析ー対応分析, CA, fviz_ca_biplot, repelー
各家庭における家事は、それぞれどんな分担傾向があるのか？？？夫のみ、妻のみ、夫婦一緒に、夫婦どちらかが、行う家事はどういった傾向がみられるのか？実施頻度の情報が、目で見て分かり易い図を作ってみます。この度は、コレスホﾟンデンス分析（対応分析...
Rでデータ解析と可視化 Rで回帰分析②ー重回帰分析, lm関数, 価格予測ー
AをB、C、Dなどの複数の要因で予測したいという場合に、重回帰分析が用いられます。例えば、住宅の価格（目的変数）を、町ごとの一人当たり犯罪率、1940年以前に建てられた持ち家の割合、ボストンの5つの雇用中心地までの距離の加重平均のデータ（説...
Rでデータ解析と可視化 Rで回帰分析① ー単回帰分析, lm関数, 残差プロット, Q-Qプロットー
車の運転速度が速いほど、ブレーキを踏んでから停止するまでに必要な距離は長くなる💡これは日常の運転でも実感できる事象かと思います。このような関係性をデータから数式で表現し、予測に活用できる手法である単回帰分析です。この記事では、車の運転速度を...
Rでデータ解析と可視化 Rで対応のない2群検定：Mann-Whitney U検定、Wilcoxon Rank-Sum 検定、箱ひげ図、バイオリンプロット
例えば、数学のテストでXクラスとYクラスで平均点に差があるのか？ないのか？を調べたいとします。このクラスの点数は、他のクラスと比べて差があるのか？？？これは、XクラスとYクラスが異なる学生からなり、それぞれが受けた数学のテストの点数を比較し...
Rでデータ解析と可視化 Rで対応のない2群検定：Student t 検定, Welch’s t検定, 箱ひげ図, バイオリンプロット,ビースウォームプロット
例えば、国語のテストがあった時に、XクラスとYクラスのテストの点数の平均値に差があるのか？ないのか？を知りたいとします。隣のクラスと差があるのか..？？各クラスのテストの点数の平均値を比較する際に使用するのは対応のない2群の検定です。各クラ...